Minimalna ilość energii, potrzebna do przekształcenia substratów w produkty reakcji chemicznej. Aby reakcja chemiczna mogła zachodzić, substraty muszą posiadać wystarczającą ilość energii, potrzebnej do pokonania bariery energii reakcji i przejść do stanu przejściowego. W sytuacji, gdy energia aktywacji jest zbyt wysoka, reakcja może zachodzić bardzo wolno, nawet jeśli jest energetycznie korzystna. Czynniki wpływające na energię aktywacji to np. temperatura czy obecność katalizatorów (enzymy).