to geny, których efekt fenotypowy może być maskowany przez geny epistatyczne. Same w sobie kodują określone cechy, ale ich ekspresja zależy od obecności lub braku genów epistatycznych. Mechanizm ten jest często obserwowany w dziedziczeniu cech złożonych i ilościowych. Zrozumienie genów hipostatycznych pozwala przewidywać fenotypy w krzyżówkach genetycznych.