to cząsteczka jednoniciowego DNA, która pełni funkcję enzymatyczną – bierze udział w katalizowaniu określonych reakcji chemicznych. Najczęściej odpowiada za przecinanie nici RNA lub DNA w określonym miejscu. W odróżnieniu od naturalnych enzymów białkowych i rybozymów, deoksyrybozymy nie występują w przyrodzie – są tworzone laboratoryjnie. Mogą być wykorzystywane np. w terapii genowej lub diagnostyce molekularnej.