Istotna teoria genetyki, według niej geny zlokalizowane są na chromosomach, będących nośnikami dziedziczności – zajmują specjalne miejsce tzw. locus, a także są ułożone liniowo. Te geny, które obecne są w jednym chromosomie noszą nazwę genów sprzężonych i najczęściej dostają się do tej samej gamety. Do rozdzielenia genów sprzężonych dochodzi w wyniku procesu crossing-over. Geny zlokalizowane na różnych chromosomach segregują się niezależnie od siebie podczas towrzenia gamet. Teoria ta została stworzona na podstawie badań Thomasa Morgana oraz wcześniejszych odkryć Gregora Mendla.