Rodzaj chromosomu eukariotycznego, w którym centromer znajduje się w połowie jego długości. W efekcie oba ramiona chromosomu mają zbliżoną długość, co daje mu wygląd litery „X”. Chromosomy metacentryczne mogą mieć różne rozmiary i zawierać różne zestawy genów, co wpływa na różnice w cechach organizmów.