Organizmy (bakterie), które wykorzystują energię chemiczną do wytwarzania związków organicznych z nieorganicznych substratów, niezależnie od dostępu do światła słonecznego. Chemoautotrofy pełnią istotną rolę w ekosystemach, w których występują, ponieważ dostarczają związki organiczne innym organizmom, niezdolnym do samodzielnego przeprowadzania procesu chemosyntezy. Przykład: bakterie metanowe, wodorowe, siarkowe.