Specyficzne miejsce, obecne w apoenzymie, które nie jest bezpośrednio związane z miejscem aktywnym enzymu. Po przyłączeniu drobnocząsteczkowych związków – efektorów (inhibitory lub aktywatory), ma zdolność wpływania na aktywność enzymu poprzez indukowanie w nim zmian konformacyjnych. Centrum allosteryczne pozwala na modulację aktywności enzymu w zależności od sygnałów zewnętrznych, takich jak zmiany stężenia substratów lub produktów reakcji.