Forma poliploidii, powstają w wyniku skrzyżowania dwóch różnych gatunków. Organizmy te posiadają zwiększoną liczbę chromosomów (dwa lub więcej niehomologicznych, diploidalnych zestawów chromosomów), które pochodzą od obydwu gatunków rodzicielskich. Allopoliploidy powstają u roślin znacznie częściej niż u zwierząt. Przykłady: muł, różne gatunki pszenicy.